Lembaga-lembaga penegakkan dan perlindungan HAM di Indonesia yang khusus didirikan oleh pemerintah meliputi Kemenkumham RI, Komnas HAM, Pengadilan HAM, Komnas Perempuan, Komnas Perlindungan Anak, Komisi Kebenaran dan rekonsiliasi.

Lembaga-lembaga penegakkan dan perlindungan HAM di Indonesia yang dibentuk oleh masyarakat yang prodemokrasi dan HAM antara lain YLBHI, Kontras, Elsam, PBHI dan lainnya. Instrumen nasional HAM yang ada di Indonesia meliputi Pancasila, UUD 1945 dan undang-undang.